接二连三出现的巨大不明生物“祸威兽”，其存在成为了日本的日常。通常兵器对其完全不起作用。迎来极限的日本政府集结了祸威兽对策专家设立了“祸威兽特设对策室专属班”（通称“祸特对”）。班长田村君男、作战立案担当官神永新二、非粒子物理学家泷明久、泛用生物学家船缘由美被选定，负责执行任务。在祸威兽危机迫近之际，突然从大气圈外出现的银色巨人。祸特对中，针对巨人对策的分析官浅见弘子（长泽雅美饰）被重新分配，和神永组成搭档。浅见的报告书上写的是——“奥特曼”